(eng: admiralty) består av flaggofficerare från graden flottiljamiral och uppåt. Om en flaggofficer tjänstgör ombord på ett rymdskepp får skeppet statusen flaggskepp. Till flaggskeppet vänder sig andra rymdskepp som ingår i samma styrka för att få order och instruktioner. Flaggofficerarnas uniformer har sett olika ut beroende på tidsperiod (Tema: Stjärnflottans uniformer):
2150- - Svart uniform med silver/rött band
2250- - Röd uniform med en eller två diagonala guldbårder framtill
2350- - Röd uniform
2800- - Violett uniform